重慶愛爾眼科醫院（總院）是愛爾眼科醫院集團在中國開設的第十家大型專業眼科醫院，于2006年7月成立。重慶愛爾眼科醫院（總院）始終以“辦人民滿意的專業眼科醫院”為基礎思路，以醫療質量、醫療安全為核心，致力于提供高品質的眼科診療服務。重慶愛爾眼科醫院（總院）也是一所集眼科醫療、保健康復、急救及眼科人才培養于一體的現代化專科醫院，建筑面積約2.1萬平米，共11層，總部醫院開設屈光手術、白內障、青光眼、眼底病、角膜病、眼整形美容、眼瞼眼眶專科、淚道疾病、綜合眼病（低視力）、小兒眼科、醫學驗光配鏡、中醫眼科共12大專科以及重慶紅十字愛爾眼庫。