南通口腔醫院位于南通市躍龍南路36號，創三級口腔醫院，建筑面積1.6萬平方米，椅位150張，床位50張。醫院成立于1988年，南通地區唯一一所公立口腔專科醫院，臨床科室設置齊全，擁有口腔專業一級學科八個，口腔內科、口腔頜面外科、口腔修復科、口腔種植科、口腔正畸科、口腔預防保健科、急診綜合科、麻醉科；二級學科四個，牙體牙髓病科、牙周病科、粘膜病科、兒童牙病科；醫技科室五個。其中牙體牙髓黏膜病科、牙周病科和正畸科是南通市臨床重點專科，種植科是南通市臨床特色專科。南通口腔醫院現為江蘇省口腔醫學會副會長單位、南通市醫學會口腔醫學分會主任委員單位，南通市口腔醫療質量控制中心，南京醫科大學教學醫院、南通大學教學醫院、蘭州大學教學醫院、蘇州衛生職業技術學院教學醫院，國家住院醫師規范化培訓基地協同醫院，上海九院領銜的“國家口腔疾病臨床醫學研究中心”核心單位，上海九院“牙頜面畸形診治”、“牙體牙髓疑難疾病診治”、“牙周疑難疾病診治”、“口腔正畸”、“兒童口腔”和“種植臨床與研究”六大專科聯盟成員，韓國登騰種植牙南通技術交流中心、南通市基本醫療保險定點單位、南通市口腔衛生干預項目指定醫院。醫院集醫療、預防、教學、科研為一體，承擔著南通市及周邊地區廣大居民口腔疾病臨床診療和預防保健任務。南通口腔醫院醫療設備先進，擁有德國錐形束口腔CT、曲面斷層全景X光機、數字化放射影像系統（DR）、X線頭影測量系統、蔡氏口腔顯微鏡、德國史塞克正頜外科動力系統、瑞士種植機等國際先進醫療設備。南通口腔醫院現有國家級理事1人、專委會常委3名、其他國家級口腔專業委員8名；省口腔醫學會副會長1名，省級專委會副主任委員5名、常委、委員、青委18名；市級主任委員1名、副主任委員1名、委員14名。高級職稱45人，中級職稱63人，口腔碩士、博士39人，其他碩士7人。承擔南京醫科大學和南通大學口腔醫學專業本科的臨床教學，以及南通大學部分本科專業口腔醫學理論授課。有南通大學兼職教授5名、講師6名。省級課題2項、市級課題6項，南通市新技術引進二、三等獎6項，發表SCI文章2篇。南通市口腔醫院作為南通市醫學會口腔醫學分會主任委員單位，承擔著指導全市醫療機構開展牙病防治及進行全市口腔衛生干預的任務，常年有一支專業的牙防隊伍，深入到學校、機關、企事業單位進行口腔健康知識宣傳和義診，每年免費為崇川區四萬名小學生進行口腔檢查和五千余名兒童進行窩溝封閉治療，為南通地區兒童口腔健康促進作出積極的貢獻。南通口腔醫院實行24小時值班制，口腔急診綜合科、口腔正畸科開展午間門診、夜間門診至晚上9點，節假日照常門診。多年來先后被評為“創建文明衛生行業示范點”、“南通市文明單位”、“南通市文明誠信窗口”、“價格誠信先進單位”、“南通市創十佳醫院先進單位”、“南通市醫院管理年先進集體”、“南通市無紅包醫院”。近三年來，醫院在南通市衛生局組織的醫療行風第三方滿意度調查中，患者滿意度一直居南通地區26家二級以上醫院前列，深受患者的好評。